Elliovirales
Les Elliovirales sont un ordre de virus de plus de 300 membres avec une enveloppe sphérique et hélicoïdale de diamètre d'environ 80 à 120 nanomètres. L'une des caractéristiques unificatrices de ces virus est la possession d'un génome à ARN simple brin tripartite et polarité négative. Les trois fragments appelés L (6300-12000 nucléotides), M (3500-6000 nucléotides) et S (1000-2200 nucléotides). La longueur totale du génome est comprise entre 10,5 et 22,7 kilobases, selon les espèces. Les trois segments du génome codent quatre protéines structurales, qui composent la particule virale, et peut-être une ou deux protéines non structurales (protéines accessoires nécessaires à la réplication).
| Groupe | Groupe V |
|---|---|
| Domaine | Riboviria |
| Règne | Orthornavirae |
| Embranchement | Negarnaviricota |
| Sous-embr. | Polyploviricotina |
| Classe | Bunyaviricetes |
Familles de rang inférieur
Cette stratégie de codage nécessite que la particule virale infectieuse contienne sa propre ARN polymérase ARN dépendante pour transcrire le génome en ARNm, qui à leur tour sont traduits pour produire de nouvelles protéines virales. La multiplication du virus se produit dans le cytoplasme des cellules infectées et les particules virales mûrissent à l'intérieur de la cellule en bourgeonnant principalement au niveau des membranes de l'appareil de Golgi. Les virus de cette famille peuvent infecter une gamme variée d'hôtes, des moustiques aux marsupiaux et des thrips aux tomates. Plusieurs des Bunyaviridae provoquent des maladies graves chez l'humain, et ils sont reconnus comme représentant une menace croissante pour la santé humaine et sont de bons exemples des infections dites émergentes[1].
Taxonomie et biologie
modifierL'ordre des Elliovirales regroupe 12 familles.
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Incohérences sur les noms des anciens genres (aujourd'hui obsolètes) : le genre Orthobunyavirus n'est pas introduit Vous pouvez y remédier.
L'ancienne nomenclature les classaient comme famille des Bunyaviridae qui était divisée en cinq genres sur la base des caractéristiques sérologiques et biochimiques. Quatre de ces genres - Bunyavirus, Hantavirus, Nairovirus et Phlebovirus - contenaient des virus infectant les vertébrés tandis que les membres du genre Tospovirus infectaient les plantes. Les membres de ces genres sont ainsi appelés bunyavirus, hantavirus, nairovirus, etc. Bien que tous les virus de la famille partagent les critères moins rigoureux décrits ci-dessus, une diversité considérable existe au niveau biologique en termes d'hôtes et de vecteurs infectés et au niveau moléculaire en termes de stratégies de codage et de réplication du génome[2].
- La plupart des virus sont transmis par des arthropodes vecteurs (et sont donc connus sous le nom d'arbovirus. En général, les bunyavirus sont transmis par des moustiques ou des moucherons, les nairovirus par des tiques et les phlébovirus par des phlébotomes ou des tiques[2]. Les bunyavirus transmis par les moustiques appartiennent au genre Orthobunyavirus. Ce genre comprend environ 170 virus : 48 espèces et 19 sérogroupes. Dans deux de ces sérogroupes se trouvent quatre virus émergents qui sont de plus en plus reconnus comme des agents pathogènes pour les humains et les animaux[3]
- Les tospovirus se propagent aux plantes[2].
- Les hantavirus ne possèdent pas d'arthropodes vecteurs mais sont maintenus dans la nature sous forme d'infections persistantes de rongeurs (d'où le terme robovirus, transmis par les rongeurs) et sont transmis à l'humain via des sécrétions infectieuses aérosolisées de rongeurs[2].
Arbovirus appartenant au genre Orthobunyavirus
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Sérogroupe California
modifierLes virus du sérogroupe California circulent partout dans le monde. Ils comprennent le virus d'Inkoo en Europe, le virus de Tahyna en Europe, en Asie et en Afrique, et le virus de La Crosse, le virus snowshoe hare et le virus de Jamestown Canyon en Amérique du Nord[4],[5].
Ce sérogroupe comprend 17 virus :
- Virus de l'encéphalite de Californie
- Virus d'Inkoo
- Virus de Jamestown Canyon
- Virus de La Crosse
- Virus snowshoe hare
- Virus de Tahyna
Sérogroupe Bunyamwera
modifierCe sérogroupe comprend 23 virus :
- Virus de Cache Valley circule partout en Amérique du Nord et en Amérique du Sud[6].
Sérogroupe Simbu
modifier- Virus Oropouche
- Virus Ikitos
Codage du génome et réplication
modifierMaladies causées par les Elliovirales
modifierLes virus de cette famille diversifiée causent des maladies chez les humains, les animaux domestiques et les plantes, ces derniers étant d'une importance économique considérable. En ce qui concerne les maladies humaines, cinq types de manifestations sont associés aux Bunyaviridae : fièvre, encéphalite, fièvre hémorragique, et un syndrome respiratoire mortel[7]. Un grand nombre de bunyavirsus sont associés à des fièvres , souvent accompagnée d'une éruption cutanée, chez l'humain, spontanément résolutives et rarement, voire jamais, mortel, l'incidence globale des infections à bunyavirus est inconnu[7].
En Europe Tahyna bunyavirus est largement distribué en Allemagne, en Italie, l'ex-Yougoslavie et la République tchèque ; dans la Moravie jusqu'à 20 % des patients hospitalisés pour maladies fébriles sont infectés par ce virus.
Oropouchele bunyavirus a provoqué des épidémies importantes, impliquant des milliers de patients au Brésil, et il est probablement répandu dans tout le Sud de l'Amérique.
La fièvre des phlébotomes et la fièvre de la vallée du Rift sont causées par des phlébovirus. Le premier est une courte, infection spontanément résolutive non mortelle. En revanche, la fièvre de la vallée du Rift présente une variété de manifestations cliniques allant d'une simple fièvre à un syndrome hémorragique.
Notes et références
modifier- (en-US) Stephen S. Morse, « Factors in the Emergence of Infectious Diseases », Emerging Infectious Diseases, Centres pour le contrôle et la prévention des maladies, vol. 1, no 1, (DOI 10.3201/eid0101.950102, lire en ligne, consulté le )
- Elliott, R.M. Emerging Viruses: The Bunyaviridae. Mol Med 3, 572–577 (1997). https://doi.org/10.1007/BF03401814
- King AMQ, Lefkowitz E, Adams MJ, Carstens EB. Family bunyaviridae. In: King AMQ, Adams MJ, Carstens EB, Lefkowitz EJ, editors. Virus Taxonomy: Ninth Report of the International Committee on Taxonomy of Viruses. San Diego: Elsevier; 2012. p. 725-741.
- Leduc JW. Epidemiology and ecology of the California serogroup viruses. Am J Trop Med Hyg. 1987;37(3) Suppl: 60S-68S.
- Putkuri N, Kurkela S, Levanov L, Huhtamo E, Vaheri A, Sironen T, Vapalahti O. Isolation and characterization of a California encephalitis serogroup orthobunyavirus from Finnish mosquitoes. Infect Genet Evol. 2014;22:164-73.
- Andreadis TG Armstrong PM, Anderson JF, Main AJ. 2014 Spatial-temporal analysis of Cache Valley virus (Bunyaviridae: Orthobunyavirus) infection in Anopheline and Culicine mosquitoes (Diptera: Culicidae) in the Northeastern United States, 1997-2012. Vector Borne Zoonotic Dis. 2014;14(10):763-773.
- Swanepoel R. (1995) Bunyaviridae. In: Zuckerman AJ, Banatvala JE, Pattison JR (eds). Principles and Practice of Clinical Virology, 3rd ed. John Wiley & Sons, Chichester, pp. 517–554.