-
Notifications
You must be signed in to change notification settings - Fork 1
/
Excluded.txt
306 lines (305 loc) · 4.59 KB
/
Excluded.txt
1
2
3
4
5
6
7
8
9
10
11
12
13
14
15
16
17
18
19
20
21
22
23
24
25
26
27
28
29
30
31
32
33
34
35
36
37
38
39
40
41
42
43
44
45
46
47
48
49
50
51
52
53
54
55
56
57
58
59
60
61
62
63
64
65
66
67
68
69
70
71
72
73
74
75
76
77
78
79
80
81
82
83
84
85
86
87
88
89
90
91
92
93
94
95
96
97
98
99
100
101
102
103
104
105
106
107
108
109
110
111
112
113
114
115
116
117
118
119
120
121
122
123
124
125
126
127
128
129
130
131
132
133
134
135
136
137
138
139
140
141
142
143
144
145
146
147
148
149
150
151
152
153
154
155
156
157
158
159
160
161
162
163
164
165
166
167
168
169
170
171
172
173
174
175
176
177
178
179
180
181
182
183
184
185
186
187
188
189
190
191
192
193
194
195
196
197
198
199
200
201
202
203
204
205
206
207
208
209
210
211
212
213
214
215
216
217
218
219
220
221
222
223
224
225
226
227
228
229
230
231
232
233
234
235
236
237
238
239
240
241
242
243
244
245
246
247
248
249
250
251
252
253
254
255
256
257
258
259
260
261
262
263
264
265
266
267
268
269
270
271
272
273
274
275
276
277
278
279
280
281
282
283
284
285
286
287
288
289
290
291
292
293
294
295
296
297
298
299
300
301
302
303
304
305
306
This document lists the VCF files filtered due to low quality standards
Indian Genomes excluded from analysis because of low quality standars are as follows,
EPI_ISL_414515
EPI_ISL_428479
EPI_ISL_428480
EPI_ISL_428481
EPI_ISL_428482
EPI_ISL_428483
EPI_ISL_428484
EPI_ISL_428485
EPI_ISL_428486
EPI_ISL_428487
EPI_ISL_435052
EPI_ISL_435072
EPI_ISL_435073
EPI_ISL_435075
EPI_ISL_435076
EPI_ISL_435077
EPI_ISL_435079
EPI_ISL_435080
EPI_ISL_435082
EPI_ISL_435087
EPI_ISL_435088
EPI_ISL_435089
EPI_ISL_435106
EPI_ISL_435107
EPI_ISL_435110
EPI_ISL_436137
EPI_ISL_436138
EPI_ISL_436139
EPI_ISL_436140
EPI_ISL_436141
EPI_ISL_436156
EPI_ISL_436157
EPI_ISL_436413
EPI_ISL_436416
EPI_ISL_436417
EPI_ISL_436419
EPI_ISL_436423
EPI_ISL_436427
EPI_ISL_436432
EPI_ISL_436434
EPI_ISL_436436
EPI_ISL_436437
EPI_ISL_436438
EPI_ISL_436439
EPI_ISL_436441
EPI_ISL_436442
EPI_ISL_436443
EPI_ISL_436446
EPI_ISL_436453
EPI_ISL_436463
EPI_ISL_437439
EPI_ISL_437441
EPI_ISL_437442
EPI_ISL_437443
EPI_ISL_437536
EPI_ISL_437537
EPI_ISL_437538
EPI_ISL_447032
EPI_ISL_447034
EPI_ISL_450414
EPI_ISL_452787
EPI_ISL_452788
EPI_ISL_452789
EPI_ISL_452790
EPI_ISL_452791
EPI_ISL_452792
EPI_ISL_452793
EPI_ISL_454521
EPI_ISL_454522
EPI_ISL_454523
EPI_ISL_454534
EPI_ISL_454535
EPI_ISL_454538
EPI_ISL_454539
EPI_ISL_454541
EPI_ISL_454544
EPI_ISL_454545
EPI_ISL_454546
EPI_ISL_454548
EPI_ISL_454550
EPI_ISL_454552
EPI_ISL_454553
EPI_ISL_454554
EPI_ISL_454555
EPI_ISL_454558
EPI_ISL_454559
EPI_ISL_454561
EPI_ISL_454562
EPI_ISL_454858
EPI_ISL_454859
EPI_ISL_454860
EPI_ISL_454861
EPI_ISL_454863
EPI_ISL_454864
EPI_ISL_454865
EPI_ISL_455015
EPI_ISL_455308
EPI_ISL_455309
EPI_ISL_455310
EPI_ISL_455311
EPI_ISL_455640
EPI_ISL_455642
EPI_ISL_455677
EPI_ISL_455750
EPI_ISL_455751
EPI_ISL_455752
EPI_ISL_455753
EPI_ISL_455756
EPI_ISL_455757
EPI_ISL_455758
EPI_ISL_455759
EPI_ISL_455760
EPI_ISL_455762
EPI_ISL_455769
EPI_ISL_455771
EPI_ISL_455772
EPI_ISL_455773
EPI_ISL_455774
EPI_ISL_455781
EPI_ISL_455782
EPI_ISL_455784
EPI_ISL_455785
EPI_ISL_455788
EPI_ISL_459912
EPI_ISL_459925
EPI_ISL_459928
EPI_ISL_459929
EPI_ISL_459930
EPI_ISL_459931
EPI_ISL_459936
EPI_ISL_459938
EPI_ISL_459939
EPI_ISL_459944
EPI_ISL_459945
EPI_ISL_459946
EPI_ISL_459947
EPI_ISL_459948
EPI_ISL_459949
EPI_ISL_459950
EPI_ISL_459951
EPI_ISL_459952
EPI_ISL_463011
EPI_ISL_463012
EPI_ISL_463015
EPI_ISL_463016
EPI_ISL_463020
EPI_ISL_463021
EPI_ISL_463023
EPI_ISL_463028
EPI_ISL_463030
EPI_ISL_463035
EPI_ISL_463040
EPI_ISL_463041
EPI_ISL_463042
EPI_ISL_463043
EPI_ISL_463044
EPI_ISL_463045
EPI_ISL_463046
EPI_ISL_463047
EPI_ISL_463048
EPI_ISL_463050
EPI_ISL_463053
EPI_ISL_463055
EPI_ISL_463057
EPI_ISL_463059
EPI_ISL_463062
EPI_ISL_463063
EPI_ISL_463065
EPI_ISL_463066
EPI_ISL_463068
EPI_ISL_463069
EPI_ISL_463070
EPI_ISL_463071
EPI_ISL_463072
EPI_ISL_463075
EPI_ISL_463077
EPI_ISL_463079
EPI_ISL_463080
EPI_ISL_463081
EPI_ISL_463082
EPI_ISL_463083
EPI_ISL_463084
EPI_ISL_463086
EPI_ISL_463090
EPI_ISL_463091
EPI_ISL_463092
EPI_ISL_463093
EPI_ISL_466839
EPI_ISL_466840
EPI_ISL_466841
EPI_ISL_466842
EPI_ISL_466843
EPI_ISL_466844
EPI_ISL_466845
EPI_ISL_466846
EPI_ISL_466847
EPI_ISL_466848
EPI_ISL_466849
EPI_ISL_466850
EPI_ISL_466851
EPI_ISL_466852
EPI_ISL_466853
EPI_ISL_466854
EPI_ISL_466855
EPI_ISL_466856
EPI_ISL_466857
EPI_ISL_466858
EPI_ISL_466859
EPI_ISL_466860
EPI_ISL_466861
EPI_ISL_466862
EPI_ISL_466863
EPI_ISL_466864
EPI_ISL_466865
EPI_ISL_466866
EPI_ISL_466867
EPI_ISL_466868
EPI_ISL_466869
EPI_ISL_466870
EPI_ISL_466871
EPI_ISL_466872
EPI_ISL_477168
EPI_ISL_477205
EPI_ISL_477209
EPI_ISL_477213
EPI_ISL_477214
EPI_ISL_477215
EPI_ISL_477216
EPI_ISL_477217
EPI_ISL_477218
EPI_ISL_477219
EPI_ISL_477220
EPI_ISL_477221
EPI_ISL_477222
EPI_ISL_477223
EPI_ISL_477224
EPI_ISL_477225
EPI_ISL_477226
EPI_ISL_477227
EPI_ISL_477228
EPI_ISL_477229
EPI_ISL_477230
EPI_ISL_477231
EPI_ISL_477232
EPI_ISL_477234
EPI_ISL_477235
EPI_ISL_477236
EPI_ISL_477240
EPI_ISL_477244
EPI_ISL_477245
EPI_ISL_477248
EPI_ISL_477251
EPI_ISL_477252
EPI_ISL_477253
EPI_ISL_477257
EPI_ISL_477259
EPI_ISL_477260
EPI_ISL_477262
EPI_ISL_477263
EPI_ISL_479525
EPI_ISL_479549
EPI_ISL_479561
EPI_ISL_479569
EPI_ISL_479573
EPI_ISL_479658
EPI_ISL_479659
EPI_ISL_479660
EPI_ISL_479661
EPI_ISL_479736
EPI_ISL_479737
EPI_ISL_479738
EPI_ISL_479739
EPI_ISL_479740
EPI_ISL_479741
EPI_ISL_479742
EPI_ISL_479743
EPI_ISL_479745
EPI_ISL_479746
EPI_ISL_479747
EPI_ISL_479748
EPI_ISL_479749
EPI_ISL_479750
EPI_ISL_479751
EPI_ISL_479752
EPI_ISL_479753
EPI_ISL_479754
EPI_ISL_479755
EPI_ISL_479776
EPI_ISL_480293
EPI_ISL_480294
EPI_ISL_480295
EPI_ISL_480296
EPI_ISL_481117
EPI_ISL_481122
EPI_ISL_481123
EPI_ISL_481134
EPI_ISL_481145
EPI_ISL_481148
EPI_ISL_481155
EPI_ISL_481161
EPI_ISL_481162
EPI_ISL_481187
EPI_ISL_481188