CPK配色
分子模型における元素の配色法
CPK配色 (英: CPK coloring)は分子模型における元素の配色法。CPK分子模型の考案者であるロバート・コリー(Robert Corey)とライナス・ポーリング(Linus Pauling)および改善者ウォルター・コルタン(Walter Koltun)にちなむ。
歴史
編集CoreyとPauling(1952年)がカリフォルニア工科大学在籍中に、タンパク質などの生体分子の空間充填モデルを考案した。彼らの模型は、原子を表す硬材の球をカットし、鮮やかな色で着色して元素ごとに色分けしたものだった。
このような配色を用いて、より小さな樹脂製の分子模型も製作された。
このコリーとポーリングの模型を発展させて特許を取ったのが、Koltun(1965年)である。特許での配色は次のとおり。
配色概要
編集以下、代表的な配色を挙げる。
水素 (H) | 白 | |
炭素 (C) | 黒 | |
窒素 (N) | 紺青 | |
酸素 (O) | 赤 | |
フッ素 (F), 塩素 (Cl) | 緑 | |
臭素 (Br) | 赤褐色[3] | |
ヨウ素 (I) | 桔梗色[4] | |
貴ガス (He, Ne, Ar, Xe, Kr) | 青緑 | |
リン (P) | 橙 | |
硫黄 (S) | 黄 | |
ホウ素 (B), most transition metals | 桃[5] | |
アルカリ金属 (Li, Na, K, Rb, Cs) | すみれ色 | |
アルカリ土類金属 (Be, Mg, Ca, Sr, Ba, Ra) | 深緑 | |
チタン (Ti) | 灰 | |
鉄 (Fe) | 橙 | |
他 | 桃[6] |
元素の純物質や代表的な化合物の色など、直感的に記憶しやすい配色となっている。水素は無色の気体、炭素は木炭や黒鉛が黒く、硫黄の結晶は黄色く、塩素は黄緑色の気体、臭素は赤褐色の液体、赤リンは赤く、錆びは暗い橙色、火(燃焼、酸化)は赤く、青い空の大気の主成分は窒素である。
配色一覧
編集1952年のコリーとポーリングの配色、1965年のコルタンの配色のほか、立体分子模型画像作成ソフトJmolの配色[7]、同Rasmolの配色[8]などがある。この4種の配色を次の表に示す。
原子 番号 |
原子 記号 |
原子名 | 色見本 | |||
---|---|---|---|---|---|---|
C [9] |
K [10] |
J [11] |
R [12] | |||
1 | H | 水素 | ||||
1 | 2H (D) | 重水素 | ||||
1 | 3H (T) | 三重水素 | ||||
2 | He | ヘリウム | ||||
3 | Li | リチウム | ||||
4 | Be | ベリリウム | ||||
5 | B | ホウ素 | ||||
6 | C | 炭素 | ||||
6 | 13C | 炭素13 | ||||
6 | 14C | 炭素14 | ||||
7 | N | 窒素 | ||||
7 | 15N | 窒素15 | ||||
8 | O | 酸素 | ||||
9 | F | フッ素 | ||||
10 | Ne | ネオン | ||||
11 | Na | ナトリウム | ||||
12 | Mg | マグネシウム | ||||
13 | Al | アルミニウム | ||||
14 | Si | ケイ素 | ||||
15 | P | リン | ||||
16 | S | 硫黄 | ||||
17 | Cl | 塩素 | ||||
18 | Ar | アルゴン | ||||
19 | K | カリウム | ||||
20 | Ca | カルシウム | ||||
21 | Sc | スカンジウム | ||||
22 | Ti | チタン | ||||
23 | V | バナジウム | ||||
24 | Cr | クロム | ||||
25 | Mn | マンガン | ||||
26 | Fe | 鉄 | ||||
27 | Co | コバルト | ||||
28 | Ni | ニッケル | ||||
29 | Cu | 銅 | ||||
30 | Zn | 亜鉛 | ||||
31 | Ga | ガリウム | ||||
32 | Ge | ゲルマニウム | ||||
33 | As | ヒ素 | ||||
34 | Se | セレン | ||||
35 | Br | 臭素 | ||||
36 | Kr | クリプトン | ||||
37 | Rb | ルビジウム | ||||
38 | Sr | ストロンチウム | ||||
39 | Y | イットリウム | ||||
40 | Zr | ジルコニウム | ||||
41 | Nb | ニオブ | ||||
42 | Mo | モリブデン | ||||
43 | Tc | テクネチウム | ||||
44 | Ru | ルテニウム | ||||
45 | Rh | ロジウム | ||||
46 | Pd | パラジウム | ||||
47 | Ag | 銀 | ||||
48 | Cd | カドミウム | ||||
49 | In | インジウム | ||||
50 | Sn | スズ | ||||
51 | Sb | アンチモン | ||||
52 | Te | テルル | ||||
53 | I | ヨウ素 | ||||
54 | Xe | キセノン | ||||
55 | Cs | セシウム | ||||
56 | Ba | バリウム | ||||
57 | La | ランタン | ||||
58 | Ce | セリウム | ||||
59 | Pr | プラセオジム | ||||
60 | Nd | ネオジム | ||||
61 | Pm | プロメチウム | ||||
62 | Sm | サマリウム | ||||
63 | Eu | ユーロピウム | ||||
64 | Gd | ガドリニウム | ||||
65 | Tb | テルビウム | ||||
66 | Dy | ジスプロシウム | ||||
67 | Ho | ホルミウム | ||||
68 | Er | エルビウム | ||||
69 | Tm | ツリウム | ||||
70 | Yb | イッテルビウム | ||||
71 | Lu | ルテチウム | ||||
72 | Hf | ハフニウム | ||||
73 | Ta | タンタル | ||||
74 | W | タングステン | ||||
75 | Re | レニウム | ||||
76 | Os | オスミウム | ||||
77 | Ir | イリジウム | ||||
78 | Pt | 白金 | ||||
79 | Au | 金 | ||||
80 | Hg | 水銀 | ||||
81 | Tl | タリウム | ||||
82 | Pb | 鉛 | ||||
83 | Bi | ビスマス | ||||
84 | Po | ポロニウム | ||||
85 | At | アスタチン | ||||
86 | Rn | ラドン | ||||
87 | Fr | フランシウム | ||||
88 | Ra | ラジウム | ||||
89 | Ac | アクチニウム | ||||
90 | Th | トリウム | ||||
91 | Pa | プロトアクチニウム | ||||
92 | U | ウラン | ||||
93 | Np | ネプツニウム | ||||
94 | Pu | プルトニウム | ||||
95 | Am | アメリシウム | ||||
96 | Cm | キュリウム | ||||
97 | Bk | バークリウム | ||||
98 | Cf | カリフォルニウム | ||||
99 | Es | アインスタイニウム | ||||
100 | Fm | フェルミウム | ||||
101 | Md | メンデレビウム | ||||
102 | No | ノーベリウム | ||||
103 | Lr | ローレンシウム | ||||
104 | Rf | ラザホージウム | ||||
105 | Db | ドブニウム | ||||
106 | Sg | シーボーギウム | ||||
107 | Bh | ボーリウム | ||||
108 | Hs | ハッシウム | ||||
109 | Mt | マイトネリウム | ||||
110 | Ds | ダームスタチウム | ||||
111 | Rg | レントゲニウム |
脚注
編集- ^ deep yellow
- ^ light, medium, medium dark, and dark green
- ^ dark red
- ^ dark violet
- ^ peach, salmon
- ^ pink
- ^ Jmol color table at sourceforge.net. Accessed on 2010-01-28.
- ^ Rasmol color table at bio.cmu.edu. Accessed on 2010-01-28.
- ^ Corey、Pauling、1952年
- ^ Koltun、1965年
- ^ Jmol
- ^ Rasmol。各2色あるが、右は2.7.3版以降のもの。
参考文献
編集- Corey, Robert B.、Pauling, Linus、1952年8月25日「Molecular Models of Amino Acids, Peptides, and Proteins」『Review of Scientific Instruments』24巻8号621~627ページ、doi:10.1063/1.1770803
- Koltun, Walter L.、1965年2月23日「Space filling atomic units and connectors for molecular models」アメリカ合衆国特許第 3,170,246号