CHMP4A

CHMP4A
Наявні структури
PDB	Пошук для людей: PDBe RCSB
Список кодів PDB
	3C3O
Ідентифікатори
Символи	CHMP4A, C14orf123, CHMP4, CHMP4B, HSPC134, SHAX2, SNF7, SNF7-1, VPS32-1, VPS32A, charged multivesicular body protein 4A
Зовнішні ІД	OMIM: 610051 HomoloGene: 69160 GeneCards: CHMP4A
Онтологія гена
Молекулярна функція	• protein homodimerization activity; • ATPase binding; • GO:0001948, GO:0016582 protein binding; • identical protein binding; • lipid binding;
Клітинна компонента	• цитоплазма; • ESCRT III complex; • гіалоплазма; • ендосома; • мембрана; • late endosome membrane; • клітинна мембрана; • midbody; • cytoplasmic side of plasma membrane; • membrane coat; • cytoplasmic vesicle membrane; • GO:0016023 cytoplasmic vesicle; • клітинне ядро;
Біологічний процес	• negative regulation of autophagosome assembly; • protein polymerization; • GO:0019067 viral life cycle; • nucleus organization; • membrane invagination; • multivesicular body assembly; • plasma membrane tubulation; • endosomal transport; • posttranslational protein targeting to endoplasmic reticulum membrane; • vesicle budding from membrane; • protein transport; • septum digestion after cytokinesis; • mitotic metaphase plate congression; • protein homooligomerization; • vacuolar transport; • negative regulation of neuron death; • macroautophagy; • viral budding via host ESCRT complex; • midbody abscission;
	Джерела:Amigo / QuickGO
Ортологи
	29082
	н/д
	ENSG00000254505; ENSG00000285302
	н/д
	Q9BY43
	н/д
	NM_014169
	н/д
	NP_054888
	н/д
	Вікідані
Див./Ред. для людей

CHMP4A (англ. Charged multivesicular body protein 4A) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 14-ї хромосоми.^[2] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 222 амінокислот, а молекулярна маса — 25 098^[3].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MSGLGRLFGK	GKKEKGPTPE	EAIQKLKETE	KILIKKQEFL	EQKIQQELQT
AKKYGTKNKR	AALQALRRKK	RFEQQLAQTD	GTLSTLEFQR	EAIENATTNA
EVLRTMELAA	QSMKKAYQDM	DIDKVDELMT	DITEQQEVAQ	QISDAISRPM
GFGDDVDEDE	LLEELEELEQ	EELAQELLNV	GDKEEEPSVK	LPSVPSTHLP
AGPAPKVDED	EEALKQLAEW	VS

A: Аланін

D: Аспарагінова кислота

E: Глутамінова кислота

F: Фенілаланін

G: Гліцин

H: Гістидин

I: Ізолейцин

K: Лізин

L: Лейцин

M: Метіонін

N: Аспарагін

P: Пролін

Q: Глутамін

R: Аргінін

S: Серин

T: Треонін

V: Валін

W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як транспорт, транспорт білків, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з ліпідами. Локалізований у мембрані, цитоплазматичних везикулах, ендосомах.

Література

Peck J.W., Bowden E.T., Burbelo P.D. (2004). Structure and function of human Vps20 and Snf7 proteins. Biochem. J. 377: 693—700. PMID 14583093 DOI:10.1042/BJ20031347
The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
Strack B., Calistri A., Craig S., Popova E., Goettlinger H.G. (2003). AIP1/ALIX is a binding partner for HIV-1 p6 and EIAV p9 functioning in virus budding. Cell. 114: 689—699. PMID 14505569 DOI:10.1016/S0092-8674(03)00653-6
Martin-Serrano J., Yarovoy A., Perez-Caballero D., Bieniasz P.D. (2003). Divergent retroviral late-budding domains recruit vacuolar protein sorting factors by using alternative adaptor proteins. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 100: 12414—12419. PMID 14519844 DOI:10.1073/pnas.2133846100
Katoh K., Shibata H., Hatta K., Maki M. (2004). CHMP4b is a major binding partner of the ALG-2-interacting protein Alix among the three CHMP4 isoforms. Arch. Biochem. Biophys. 421: 159—165. PMID 14678797 DOI:10.1016/j.abb.2003.09.038
Lin Y., Kimpler L.A., Naismith T.V., Lauer J.M., Hanson P.I. (2005). Interaction of the mammalian endosomal sorting complex required for transport (ESCRT) III protein hSnf7-1 with itself, membranes, and the AAA+ ATPase SKD1. J. Biol. Chem. 280: 12799—12809. PMID 15632132 DOI:10.1074/jbc.M413968200

Примітки

↑ Human PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:20274 (англ.) . Архів оригіналу за 10 вересня 2015. Процитовано 11 вересня 2017.
↑ UniProt, Q9BY43 (англ.) . Архів оригіналу за 26 жовтня 2017. Процитовано 11 вересня 2017.