KIRREL1

KIRREL1
Наявні структури PDB Пошук ортологів: PDBe RCSB Список кодів PDB 4OFD
Ідентифікатори
Символи	KIRREL1, NEPH1, KIRREL, kin of IRRE like (Drosophila), Kin of IRRE-like protein 1, kirre like nephrin family adhesion molecule 1, NPHS23
Зовнішні ІД	OMIM: 607428 MGI: 1891396 HomoloGene: 10089 GeneCards: KIRREL1
Пов'язані генетичні захворювання
ожиріння
Онтологія гена Молекулярна функція • myosin binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding Клітинна компонента • dendritic shaft • integral component of membrane • perinuclear region of cytoplasm • membrane raft • клітинна мембрана • мембрана • cell projection membrane • cell-cell junction Біологічний процес • GO:0033128 negative regulation of protein phosphorylation • виділення • positive regulation of actin filament polymerization • cell-cell adhesion Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	55243	170643
Ensembl	ENSG00000183853	ENSMUSG00000041734
UniProt	Q96J84	Q80W68
RefSeq (мРНК)	NM_001286349 NM_018240	NM_001170985 NM_130867 NM_001377046
RefSeq (білок)	NP_001273278 NP_060710	NP_001164456 NP_570937 NP_001363975
Локус (UCSC)	Хр. 1: 157.99 – 158.1 Mb	Хр. 3: 86.99 – 87.08 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

KIRREL1 (англ. Kirre like nephrin family adhesion molecule 1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 1-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 757 амінокислот, а молекулярна маса — 83 536.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MLSLLVWILT		LSDTFSQGTQ		TRFSQEPADQ		TVVAGQRAVL		PCVLLNYSGI
VQWTKDGLAL		GMGQGLKAWP		RYRVVGSADA		GQYNLEITDA		ELSDDASYEC
QATEAALRSR		RAKLTVLIPP		EDTRIDGGPV		ILLQAGTPHN		LTCRAFNAKP
AATIIWFRDG		TQQEGAVAST		ELLKDGKRET		TVSQLLINPT		DLDIGRVFTC
RSMNEAIPSG		KETSIELDVH		HPPTVTLSIE		PQTVQEGERV		VFTCQATANP
EILGYRWAKG		GFLIEDAHES		RYETNVDYSF		FTEPVSCEVH		NKVGSTNVST
LVNVHFAPRI		VVDPKPTTTD		IGSDVTLTCV		WVGNPPLTLT		WTKKDSNMVL
SNSNQLLLKS		VTQADAGTYT		CRAIVPRIGV		AEREVPLYVN		GPPIISSEAV
QYAVRGDGGK		VECFIGSTPP		PDRIAWAWKE		NFLEVGTLER		YTVERTNSGS
GVLSTLTINN		VMEADFQTHY		NCTAWNSFGP		GTAIIQLEER		EVLPVGIIAG
ATIGASILLI		FFFIALVFFL		YRRRKGSRKD		VTLRKLDIKV		ETVNREPLTM
HSDREDDTAS		VSTATRVMKA		IYSSFKDDVD		LKQDLRCDTI		DTREEYEMKD
PTNGYYNVRA		HEDRPSSRAV		LYADYRAPGP		ARFDGRPSSR		LSHSSGYAQL
NTYSRGPASD		YGPEPTPPGP		AAPAGTDTTS		QLSYENYEKF		NSHPFPGAAG
YPTYRLGYPQ		APPSGLERTP		YEAYDPIGKY		ATATRFSYTS		QHSDYGQRFQ
QRMQTHV

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах як поліморфізм, альтернативний сплайсинг. Локалізований у клітинній мембрані, мембрані.

Література

• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504

Див. також

• Хромосома 1