SH3GLB1

SH3GLB1
Наявні структури PDB Пошук ортологів: PDBe RCSB Список кодів PDB 1X43
Ідентифікатори
Символи	SH3GLB1, Bif-1, PPP1R70, dJ612B15.2, CGI-61, SH3 domain containing GRB2 like endophilin B1, SH3 domain containing GRB2 like, endophilin B1
Зовнішні ІД	OMIM: 609287 MGI: 1859730 HomoloGene: 9337 GeneCards: SH3GLB1
Онтологія гена Молекулярна функція • protein homodimerization activity • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • identical protein binding • lipid binding • cadherin binding Клітинна компонента • цитоплазма • комплекс Ґольджі • мембрана • Golgi membrane • мітохондріальна зовнішня мембрана • autophagosome membrane • midbody • мітохондрія • екзосома • GO:0016023 cytoplasmic vesicle • гіалоплазма Біологічний процес • cellular response to glucose starvation • regulation of cytokinesis • regulation of protein stability • positive regulation of autophagosome assembly • positive regulation of autophagy • positive regulation of protein targeting to mitochondrion • cellular response to amino acid starvation • receptor catabolic process • автофагія • protein complex oligomerization • membrane fission • positive regulation of protein oligomerization • positive regulation of membrane tubulation • autophagic cell death • regulation of macroautophagy • protein localization to vacuolar membrane • GO:0097285 апоптоз Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	51100	54673
Ensembl	ENSG00000097033	ENSMUSG00000037062
UniProt	Q9Y371	Q9JK48
RefSeq (мРНК)	NM_001206651 NM_001206652 NM_001206653 NM_016009	NM_001282037 NM_001282042 NM_019464 NM_001379170 NM_001379171 NM_001379172 NM_001379173 NM_001379174
RefSeq (білок)	NP_001193580 NP_001193581 NP_001193582 NP_057093	NP_001268966 NP_001268971 NP_062337 NP_001366099 NP_001366100 NP_001366101 NP_001366102 NP_001366103
Локус (UCSC)	Хр. 1: 86.7 – 86.75 Mb	Хр. 3: 144.39 – 144.43 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

SH3GLB1 (англ. SH3 domain containing GRB2 like, endophilin B1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 1-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 365 амінокислот, а молекулярна маса — 40 796.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MNIMDFNVKK		LAADAGTFLS		RAVQFTEEKL		GQAEKTELDA		HLENLLSKAE
CTKIWTEKIM		KQTEVLLQPN		PNARIEEFVY		EKLDRKAPSR		INNPELLGQY
MIDAGTEFGP		GTAYGNALIK		CGETQKRIGT		ADRELIQTSA		LNFLTPLRNF
IEGDYKTIAK		ERKLLQNKRL		DLDAAKTRLK		KAKAAETRNS		SEQELRITQS
EFDRQAEITR		LLLEGISSTH		AHHLRCLNDF		VEAQMTYYAQ		CYQYMLDLQK
QLGSFPSNYL		SNNNQTSVTP		VPSVLPNAIG		SSAMASTSGL		VITSPSNLSD
LKECSGSRKA		RVLYDYDAAN		STELSLLADE		VITVFSVVGM		DSDWLMGERG
NQKGKVPITY		LELLN

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах як апоптоз, автофагія, ацетиляція, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з ліпідами. Локалізований у цитоплазмі, мембрані, мітохондрії, цитоплазматичних везикулах, зовнішній мембрані мітохондрій, апараті гольджі.

Література

• Modregger J., Schmidt A.A., Ritter B., Huttner W.B., Plomann M. (2003). Characterization of endophilin B1b, a brain-specific membrane-associated lysophosphatidic acid acyl transferase with properties distinct from endophilin A1. J. Biol. Chem. 278: 4160—4167. PMID 12456676 DOI:10.1074/jbc.M208568200
• Lai C.-H., Chou C.-Y., Ch'ang L.-Y., Liu C.-S., Lin W.-C. (2000). Identification of novel human genes evolutionarily conserved in Caenorhabditis elegans by comparative proteomics. Genome Res. 10: 703—713. PMID 10810093 DOI:10.1101/gr.10.5.703
• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Karbowski M., Jeong S.-Y., Youle R.J. (2004). Endophilin B1 is required for the maintenance of mitochondrial morphology. J. Cell Biol. 166: 1027—1039. PMID 15452144 DOI:10.1083/jcb.200407046
• Thoresen S.B., Pedersen N.M., Liestol K., Stenmark H. (2010). A phosphatidylinositol 3-kinase class III sub-complex containing VPS15, VPS34, Beclin 1, UVRAG and BIF-1 regulates cytokinesis and degradative endocytic traffic. Exp. Cell Res. 316: 3368—3378. PMID 20643123 DOI:10.1016/j.yexcr.2010.07.008

Див. також

• Хромосома 1