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- Allgemeine Pathologie und Therapie als mechanische Naturwissenschaften. Weidmann, Leipzig 1842 Google; 2. Auflage 1848 Google, Google
- Ueber den Begriff der Schönheit, Vandenhoeck und Ruprecht, Göttingen 1845 (abgedruckt aus den Göttinger Studien; weiterer Scan)
- Ueber Bedingungen der Kunstschönheit, Vandenhoeck und Ruprecht, Göttingen 1847 (abgedruckt aus den Göttinger Studien)
- Allgemeine Physiologie des koerperlichen Lebens, Weidmann’sche Buchhandlung, Leipzig 1851
- Medicinische Psychologie oder Physiologie der Seele, Weidmann’sche Buchhandlung, Leipzig 1852 (weiterer Scan); anastatischer Neudruck A. Dannenberg, Berlin 1896 (mit Bild Lotzes)
- Mikrokosmus. Ideen zur Naturgeschichte und Geschichte der Menschheit. Versuch einer Anthropologie, S. Hirzel, Leipzig 1856–1864 (dieses Werk machte ihn in seiner Zeit über die Fachgrenzen hinaus bekannt)
- Erster Band, 1856 (Der Leib, Die Seele, Das Leben; weiterer Scan, dito); 2. Auflage 1869; 3. Auflage 1876 (weiterer Scan); 4. Auflage 1884; 5. Auflage 1896 (mit Bild Lotzes)
- Zweiter Band, 1858 (Der Mensch, Der Geist, Der Welt Lauf; weiterer Scan, dito, dito); 2. Auflage 1869; 3. Auflage 1878 (weiterer Scan); 4. Auflage 1885 (weiterer Scan); 5. Auflage 1905
- Dritter Band, 1864 (Die Geschichte, Der Fortschritt, Der Zusammenhang der Dinge; weiterer Scan, dito); 2. Auflage 1872 (weiterer Scan, dito); 3. Auflage 1880; 4. Auflage 1888 (weiterer Scan)
- Streitschriften. Erstes Heft. In Bezug auf Prof. I. H. Fichte’s Anthropologie, S. Hirzel, Leipzig 1857 (weiterer Scan)
- Geschichte der Aesthetik in Deutschland, J. G. Cotta’sche Buchhandlung, München 1868 (Band 7 von Geschichte der Wissenschaften in Deutschland. Neuere Zeit; weiterer Scan, dito, dito)
- System der Philosophie, S. Hirzel, Leipzig 1874/1879 (ein geplanter dritter Teil kam nicht mehr zur Ausführung)
- Reihe Dictate/Diktate aus den Vorlesungen, S. Hirzel, Leipzig 1881–1884
- Robert Lotze (Hrsg.): Grundzüge der Psychologie, 1881 (Wintersemester 1880/81; mit Verzeichniß der literarischen Publicationen Hermann Lotze’s; weiterer Scan, dito); Eduard Rehnisch (Hrsg.): 2. Auflage 1882 (weiterer Scan)
- Grundzüge der Religionsphilosophie, 1882 (Wintersemester 1878/79); 2. Auflage 1884 (Sommersemester 1875 und Wintersemester 1878/79; weiterer Scan)
- Grundzüge der Naturphilosophie, 1882 (Wintersemester 1876/77; mit Lotze’s Abgangszeugniß von der Universität Leipzig; weiterer Scan)
- Grundzüge der praktischen Philosophie, 1882 (Sommersemester 1880); 2. Auflage 1884 (Sommersemester 1878; weiterer Scan)
- Geschichte der deutschen Philosophie seit Kant, 1882 (Sommersemester 1879; mit Uebersicht über Hermann Lotze’s Lehrthätigkeit an den Universitäten Leipzig, Göttingen und Berlin 1839–1881); 2. Auflage 1894 (weiterer Scan)
- Grundzüge der Metaphysik, 1883 (Ontologie, Kosmologie, Phänomenologie; weiterer Scan)
- Grundzüge der Logik und Encyklopädie der Philosophie, 1883 (weiterer Scan); 2. Auflage 1885 (weiterer Scan); 3. Auflage 1891
- Grundzüge der Aesthetik, 1884 (Sommersemester 1856; mit Anhang Zur Biographie Hermann Lotze’s von Eduard Rehnisch)
- David Peipers (Hrsg.): Kleine Schriften, S. Hirzel, Leipzig 1885–1891
- Walther Herberz: Der Zweckbegriff bei Lotze, Diss. Breslau 1901 USB Köln
