« Connectome » : différence entre les versions
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Le '''connectome''' est un plan complet des connexions [[neurone|neuronales]] d'un [[cerveau]].
La production et l'étude des connectomes est la [[connectomique]]. À l'échelle microscopique, elle décrit la disposition des neurones et des [[synapse]]s dans tout ou partie du [[système nerveux]] d'un organisme. À l'échelle "macroscopique", elle étudie la connectivité fonctionnelle et structurelle entre toutes les [[aire cérébrale|aires corticales]] et les structures sous-corticales.
En fait, on peut distinguer la connectivité structurelle, fonctionnelle et effective.
La connectivité structurelle fait référence aux connexions physiques entre différentes régions du cerveau. Il s’agit principalement des voies anatomiques formées par les axones et des faisceaux de matière blanche qui relient les neurones et les régions du cerveau <ref>{{Article|langue=en|auteur1=Sporns, O.|auteur2=Tononi, G.|auteur3=Kötter, R.|titre=The human connectome: a structural description of the human brain|périodique=PLoS Computational Biology|volume=1|numéro=4|pages=e42|date=2005|doi=10.1371/journal.pcbi.0010042}}</ref>.
La connectivité fonctionnelle fait référence aux dépendances statistiques entre différentes régions du cerveau, indiquant comment ces régions se co-activent au fil du temps. Elle est basée sur les corrélations temporelles de l'activité neuronale et est souvent déduite des données obtenues par imagerie par résonance magnétique fonctionnelle ([[IRMf]]) ou électroencéphalographie ([[électroencéphalographie|EEG]])<ref>{{Article|langue=en|auteur1=Buckner, RL|auteur2=Krienen, FM|auteur3=Yeo, BT|titre=Opportunities and limitations of intrinsic functional connectivity MRI|périodique=Nature Neuroscience|volume=16|numéro=7|pages=832–837|date=juillet 2013|doi=10.1038/nn.3423|pmid=23799476|s2cid=17141252}}</ref>.
La connectivité effective fait référence à l'influence causale qu'une région du cerveau exerce sur une autre, ou aux interactions dirigées entre les régions du cerveau. Ce concept vise à comprendre la directionnalité et la force de l'influence entre les systèmes neuronaux et comment les régions du cerveau communiquent entre elles de manière dynamique. La connectivité effective est souvent évaluée à l'aide de la modélisation causale dynamique (DCM)<ref>{{Article|langue=en|auteur=Friston, K|titre=Causal modelling and brain connectivity in functional magnetic resonance imaging|périodique=PLOS Biology|volume=7|numéro=2|pages=e33|date=février 2009|doi=10.1371/journal.pbio.1000033|pmc=2642881|pmid=19226186}}</ref>, ou de la causalité de [[Clive_W._J._Granger|Granger]]<ref name="Granger">{{Article|langue=en|auteur1=A. Crimi|auteur2=L. Dodero|auteur3=F. Sambataro|auteur4=V. Murino|auteur5=D. Sona|titre=Structurally Constrained Effective Brain Connectivity|périodique=NeuroImage|volume=239|numéro=1|date= octobre 2021|pages=118288|doi=10.1016/j.neuroimage.2021.118288}}</ref>.
La définition formelle de la connectivité effective est plus controversée que les autres connectivités.
L'approche probablement la plus connue pour la définir est le DCM introduit par [[Karl J. Friston]]. Cependant, cette approche a été fortement critiquée pour sa charge computationnelle, qui est irréalisable à l'échelle cérébrale <ref>{{Article|langue=en|auteur1=A. Razi|auteur2=M.L. Seghier|auteur3=Y. Zhou|auteur4=P. McColgan|auteur5=P. Zeidman|auteur6=H.-J. Park|auteur7=O. Sporns|auteur8=G. Rees|auteur9=K.J. Friston|titre=Large-scale DCMs for resting-state fMRI|périodique=Netw. Neurosci.|volume=1|numéro=3|année=2017|pages=222-241|doi=10.1162/NETN_a_00015}}</ref>
. La connectivité effective définie par la causalité de Granger a été principalement étudiée par [[Anil Seth]] et est plus faisable pour des calculs à l'échelle cérébrale. Cela a également été critiqué comme une approche axée sur les données de corrélation temporelle plutôt que sur une véritable causalité <ref>{{Article|langue=en|auteur1=A. Etkin|titre=Addressing the causality gap in human psychiatric neuroscience|périodique=JAMA Psychiatry|volume=75|numéro=1|année=2018|pages=3-4|doi=10.1001/jamapsychiatry.2017.3587}}</ref>. Des approches plus récentes, comme la combinaison de la connectivité fonctionnelle et structurelle introduite par Alessandro Crimi ("fonctionnelles et effective liés par la structure"), répondent à certains de ces problèmes <ref name="Granger" />.
== Origine, utilisations et définition du terme « ''connectome ''» ==
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