מיקרוסטלייט

מיקרוסטלייט (באנגלית: Microsatellite) הוא אזור גנומי המורכב מחזרות רבות של רצף קצר בן 2–6 נוקלאוטידים. המיקרוסטלייטים משמשים כמרקרים גנטיים הודות לגיוון הרב הקיים בהם באוכלוסייה. הגיוון הזה נובע ממספר החזרות המשתנה של המיקרוסטלייטים באנשים שונים.

מאפיינים

דוגמה נפוצה למיקרוסטלייט היא (CA(n כש-n הוא מספר הפעמים שהרצף CA חוזר על עצמו והוא משתנה באללים שונים. מספר הנוקלאוטידים של הרצף החוזרני הוא לרוב 1 עד 4, אם כי גם 5 ו-6 קיימים ומספר הפעמים שהרצף חוזר על עצמו נע בין 3 ל-100 חזרות. החזרה CA נפוצה מאוד אצל בני אדם וביצורים אחרים והיא מופיעה כל כמה אלפי בסיסים. הסיבה לפולימורפיזם הרב במיקרוסטלייטים היא הקצב הגבוה של אירועי המוטציות (שינויים ב-DNA) באזורים אלו, שנובע מהנטייה של רצפים מסוג זה ליצור לולאה בזמן הכפלתם, המובילה לאירוע של הַחְדׇּרׇה (insertion – הוספת נוקלאוטיד או מספר נוקלאוטידים אל תוך רצף DNA קיים).

שימושים

מיקרוסטלייט יכול לעבור הגברה בתגובת PCR על ידי שימוש ברצפים הצדדיים של המיקרוסטלייט כתחלים. תהליך זה יכול ליצור מספיק DNA כדי לראותו לאחר הרצה בג'ל אלקטרופורזה וצביעתו בעזרת צבען DNA כגון אתידיום ברומיד. הודות לכך פותחה שיטת אבחון גנטי המשתמשת במיקרוסטלייטים כדי להבדיל בין פרטים שונים מאותו המין, תוך השוואת דגימות הDNA שלהם. דוגמאות לשימוש בשיטה:

1. הפללת חשוד על פי דגימת דם, שיער, רוק, זרע שנמצאו בזירת האירוע.
2. בדיקת אבהות.

לאחר הרצה בג'ל מתקבלים 2 בנדים (פסים של DNA באורך מסוים המתקבלים לאחר הרצתו בג'ל) עבור כל אדם (לכל כרומוזום 2 עותקים – אחד מהאם ואחד מהאב ולכן מתקבלים 2 בנדים בסוף הבדיקה). על ידי השוואת תוצרי ההרצה בג'ל של בדיקה זו ניתן לאמת או להפריך קשר בין 2 דגימות, למשל – מציאת התאמה בין DNA של חשוד בפשע ובין DNA שנמצא בזירת הפשע: אם 2 הבנדים של ה-DNA מזירת הפשע ושל החשוד יוצאים זהים – יש התאמה.

על אף שהסיכוי שלשני אנשים זרים יהיו אללים זהים במיקרוסטלייט מסוים הוא מאוד נמוך,^{[דרוש מקור]} כדי לצמצם את האפשרות הזו למינימום האפשרי מבצעים את הבדיקה על מספר מיקרוסטלייטים במקביל.

קישורים חיצוניים

מדיה וקבצים בנושא מיקרוסטלייט בוויקישיתוף

• אתר האינטרנט הרשמי של מיקרוסטלייט