COL1A2
Перейти до навігації
Перейти до пошуку
COL1A2 (англ. Collagen type I alpha 2 chain) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 7-ї хромосоми.[5] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 1 366 амінокислот, а молекулярна маса — 129 314[6].
Послідовність амінокислот
10 | 20 | 30 | 40 | 50 | ||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|
MLSFVDTRTL | LLLAVTLCLA | TCQSLQEETV | RKGPAGDRGP | RGERGPPGPP | ||||
GRDGEDGPTG | PPGPPGPPGP | PGLGGNFAAQ | YDGKGVGLGP | GPMGLMGPRG | ||||
PPGAAGAPGP | QGFQGPAGEP | GEPGQTGPAG | ARGPAGPPGK | AGEDGHPGKP | ||||
GRPGERGVVG | PQGARGFPGT | PGLPGFKGIR | GHNGLDGLKG | QPGAPGVKGE | ||||
PGAPGENGTP | GQTGARGLPG | ERGRVGAPGP | AGARGSDGSV | GPVGPAGPIG | ||||
SAGPPGFPGA | PGPKGEIGAV | GNAGPAGPAG | PRGEVGLPGL | SGPVGPPGNP | ||||
GANGLTGAKG | AAGLPGVAGA | PGLPGPRGIP | GPVGAAGATG | ARGLVGEPGP | ||||
AGSKGESGNK | GEPGSAGPQG | PPGPSGEEGK | RGPNGEAGSA | GPPGPPGLRG | ||||
SPGSRGLPGA | DGRAGVMGPP | GSRGASGPAG | VRGPNGDAGR | PGEPGLMGPR | ||||
GLPGSPGNIG | PAGKEGPVGL | PGIDGRPGPI | GPAGARGEPG | NIGFPGPKGP | ||||
TGDPGKNGDK | GHAGLAGARG | APGPDGNNGA | QGPPGPQGVQ | GGKGEQGPPG | ||||
PPGFQGLPGP | SGPAGEVGKP | GERGLHGEFG | LPGPAGPRGE | RGPPGESGAA | ||||
GPTGPIGSRG | PSGPPGPDGN | KGEPGVVGAV | GTAGPSGPSG | LPGERGAAGI | ||||
PGGKGEKGEP | GLRGEIGNPG | RDGARGAPGA | VGAPGPAGAT | GDRGEAGAAG | ||||
PAGPAGPRGS | PGERGEVGPA | GPNGFAGPAG | AAGQPGAKGE | RGAKGPKGEN | ||||
GVVGPTGPVG | AAGPAGPNGP | PGPAGSRGDG | GPPGMTGFPG | AAGRTGPPGP | ||||
SGISGPPGPP | GPAGKEGLRG | PRGDQGPVGR | TGEVGAVGPP | GFAGEKGPSG | ||||
EAGTAGPPGT | PGPQGLLGAP | GILGLPGSRG | ERGLPGVAGA | VGEPGPLGIA | ||||
GPPGARGPPG | AVGSPGVNGA | PGEAGRDGNP | GNDGPPGRDG | QPGHKGERGY | ||||
PGNIGPVGAA | GAPGPHGPVG | PAGKHGNRGE | TGPSGPVGPA | GAVGPRGPSG | ||||
PQGIRGDKGE | PGEKGPRGLP | GLKGHNGLQG | LPGIAGHHGD | QGAPGSVGPA | ||||
GPRGPAGPSG | PAGKDGRTGH | PGTVGPAGIR | GPQGHQGPAG | PPGPPGPPGP | ||||
PGVSGGGYDF | GYDGDFYRAD | QPRSAPSLRP | KDYEVDATLK | SLNNQIETLL | ||||
TPEGSRKNPA | RTCRDLRLSH | PEWSSGYYWI | DPNQGCTMDA | IKVYCDFSTG | ||||
ETCIRAQPEN | IPAKNWYRSS | KDKKHVWLGE | TINAGSQFEY | NVEGVTSKEM | ||||
ATQLAFMRLL | ANYASQNITY | HCKNSIAYMD | EETGNLKKAV | ILQGSNDVEL | ||||
VAEGNSRFTY | TVLVDGCSKK | TNEWGKTIIE | YKTNKPSRLP | FLDIAPLDIG | ||||
GADQEFFVDI | GPVCFK |
Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном кальцію. Локалізований у позаклітинному матриксі. Також секретований назовні.
- Dalgleish R. (1997). The human type I collagen mutation database. Nucleic Acids Res. 25: 181—187. PMID 9016532 DOI:10.1093/nar/25.1.181
- The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
- Kuivaniemi H., Tromp G., Chu M.-L., Prockop D.J. (1988). Structure of a full-length cDNA clone for the prepro alpha 2(I) chain of human type I procollagen. Comparison with the chicken gene confirms unusual patterns of gene conservation. Biochem. J. 252: 633—640. PMID 3421913 DOI:10.1042/bj2520633
- Dickson L.A., de Wet W., Di Liberto M., Weil D., Ramirez F. (1985). Analysis of the promoter region and the N-propeptide domain of the human pro alpha 2(I) collagen gene. Nucleic Acids Res. 13: 3427—3438. PMID 4011429 DOI:10.1093/nar/13.10.3427
- Click E.M., Bornstein P. (1970). Isolation and characterization of the cyanogen bromide peptides from the alpha 1 and alpha 2 chains of human skin collagen. Biochemistry. 9: 4699—4706. PMID 5529814 DOI:10.1021/bi00826a012
- Fietzek P.P., Furthmayr H., Kuehn K. (1974). Comparative sequence studies on alpha2-CB2 from calf, human, rabbit and pig-skin collagen. Eur. J. Biochem. 47: 257—261. PMID 4412529 DOI:10.1111/j.1432-1033.1974.tb03689.x
- ↑ Захворювання, генетично пов'язані з COL1A2 переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
- ↑ Сполуки, які фізично взаємодіють з COL1A2 переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
- ↑ Human PubMed Reference:.
- ↑ Mouse PubMed Reference:.
- ↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:2198 (англ.) . Архів оригіналу за 23 червня 2017. Процитовано 6 лютого 2017.
- ↑ UniProt, P08123 (англ.) . Архів оригіналу за 20 грудня 2016. Процитовано 6 лютого 2017.
Це незавершена стаття про білки. Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її. |